Si tratta di un processo finalizzato alla distruzione dei germi patogeni ed alla riduzione del numero di altri organismi. Può essere condotto con il calore o con agenti chimici di disinfezione. Nel settore civile ed industriale vengono principalmente utilizzati per i servizi di Disinfezione-germicida agenti chimici. Tra questi i più conosciuti e più usati sono:
			Composti a base di cloro Sali di ammonio quaternari
			Ambedue hanno una elevata capacità distruttiva nei confronti dei batteri. I Sali di ammonio quaternari hanno però il vantaggio di essere dotati di una maggiore capacità penetrazione nelle superfici non lisce. Di importanza fondamentale, prima di una disinfezione è la detersione della superficie da trattare, perché una disinfezione viene minimizzata dalla presenza di residui di grasso e sporco, come dalla presenza di liquidi (un esempio sono le cucine di ristoranti, alberghi, locali pattumiera, servizi igienici, reparti doccia in palestre, ecc..)